ตามพระราชบัญญัติการอุดมศึกษา พ.ศ.2562 มาตรา 42 สถาบันอุดมศึกษาต้องเปิดเผยข้อมูลที่เกี่ยวกับการดำเนินงานของสถาบันอุดมศึกษานั้นแก่สาธารณะ ตามหลักเกณฑ์ วิธีการ และระยะเวลาที่กำหนดในกฎกระทรวง และมาตรา 43 ให้ส่งข้อมูลเกี่ยวกับการอุดมศึกษาและการอื่นที่เกี่ยวข้องให้แก่กระทรวงตามที่ได้รับการร้องขอ โดยสำนักงานปลัดกระทรวงการอุดมศึกษา วิทยาศาสตร์ วิจัยและนวัตกรรม  (สกอ.เดิม) จึงกำหนดให้สถาบันอุดมศึกษาทุกแห่งส่งข้อมูลผลการดำเนินการในระดับส่วนงานและสถาบันเข้าสู่ระบบ CHE QA Online โดยให้ถือว่าเป็นการจัดทำรายงานการประเมินตนเองที่จัดส่งให้หน่วยงานต้นสังกัด ซึ่งมหาวิทยาลัยมหิดลได้จัดทำรายงานการประเมินตนเองในระบบ CHE QA Online มาโดยตลอดตั้งแต่ปีการศึกษา 2552 ในปีการศึกษา 2557 สำนักงานคณะกรรมการการอุดมศึกษา (สกอ.) ปรับปรุงระบบ CHE QA Online ให้มีการประเมินผลการดำเนินการ 3 ระดับ คือ ระดับหลักสูตร ระดับคณะ และระดับสถาบัน โดยระบบจะเปิดให้เข้าไปบันทึกข้อมูลในช่วงเดือนสิงหาคม – พฤศจิกายน ของทุกปี

               คณะวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยมหิดล ดำเนินการบันทึกข้อมูลในระบบ CHE QA Online มาตั้งแต่ปี 2558  มีหลักสูตรปริญญาตรี/ปริญญาโท/ปริญญาเอก จำนวน 48 หลักสูตร (หลักสูตรปริญญาตรี จำนวน 12 หลักสูตร (หลักสูตรไทย 6 หลักสูตร / หลักสูตรนานาชาติ 6 หลักสูตร) /ปริญญาโท จำนวน 18 หลักสูตร  /ปริญญาเอก จำนวน 18 หลักสูตร) มีการบันทึกข้อมูลระบบ CHE QA Online ครบทั้ง 48 หลักสูตร ดังนี้